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基因編輯工具箱多了把“瑞士軍刀”

2021-09-06 15:12:02 來源:

  科技日報北京9月5日電(記者張夢然)據(jù)近日發(fā)表在《分子細(xì)胞》雜志上的一項研究,一種名為CasMINI的緊湊高效的CRISPR-Cas系統(tǒng)可廣泛用于細(xì)胞工程和基因治療,因為它更容易進(jìn)入細(xì)胞。

  美國斯坦福大學(xué)生物工程助理教授齊磊表示,這是CRISPR基因組工程應(yīng)用向前邁出的關(guān)鍵一步。據(jù)我們所知,作為一種基因組編輯技術(shù),這是迄今為止最小的CRISPR。如果將Cas9視為分子剪刀,那么我們創(chuàng)造的就是一把包含多種功能的瑞士軍刀。

  CRISPR-Cas系統(tǒng)為開發(fā)各種遺傳疾病的基因療法提供了機會,但它們尺寸太大,遞送到細(xì)胞、組織或生物體中會受限制,從而阻礙臨床應(yīng)用,因此需要設(shè)計更加高效、緊湊的Cas系統(tǒng)。

  一種可能的解決方案是Cas12f。該蛋白介于400—700個氨基酸之間,大小還不到目前使用的CRISPR系統(tǒng)(如Cas9或Cas12a)的一半。近年來已經(jīng)鑒定出數(shù)千個CRISPR。齊磊解釋說,然而,超過99。9%的已發(fā)現(xiàn)CRISPR無法在人類細(xì)胞中發(fā)揮作用,這限制了它們作為基因組編輯技術(shù)的使用。

  在這項新研究中,齊磊及其團隊將RNA和蛋白工程應(yīng)用于Cas12f系統(tǒng),以生成用于哺乳動物基因組工程的高效微型Cas系統(tǒng)。Cas12f天然起源于古細(xì)菌(單細(xì)胞生物),這意味著它不太適合哺乳動物細(xì)胞,更不用說人類細(xì)胞或身體。但通過優(yōu)化單向?qū)NA設(shè)計并進(jìn)行多輪迭代蛋白工程和篩選,研究人員最終生成了一類名為CasMINI的Cas12f變體。

  工程化的Cas12f蛋白變體與工程化的單向?qū)NA相結(jié)合,表現(xiàn)出有效的基因調(diào)控和基因編輯活性。CasMINI可以驅(qū)動與Cas12a相關(guān)的高水平基因活性,并允許進(jìn)行穩(wěn)健的堿基編輯和基因編輯。此外,它具有高度特異性,不會產(chǎn)生可檢測的脫靶效應(yīng)。

  工程化CasMINI分子的大小僅為529個氨基酸。這種小尺寸使其適用于廣泛的治療。此外,CasMINImRNA可以很容易地包裝到脂質(zhì)納米顆粒或其他RNA遞送方式中,潛在地增強了其進(jìn)入細(xì)胞的能力。

  微型CasMINI的可及性實現(xiàn)了新的應(yīng)用,從體外應(yīng)用(例如設(shè)計更好的腫瘤殺傷淋巴細(xì)胞或重編程干細(xì)胞)到體內(nèi)基因療法(治療眼睛、肌肉或肝臟的遺傳疾病)。齊磊說,它將成為治療遺傳疾病、治愈癌癥和逆轉(zhuǎn)器官退化的方法。

  總編輯圈點

  與前幾代基因編輯工具,如鋅指酶相比,CRISPR系統(tǒng)已經(jīng)憑借其成本低廉、簡便易用,風(fēng)靡全球眾多生物醫(yī)學(xué)實驗室,成為該領(lǐng)域無數(shù)科研人員手中的高效工具。盡管如此,CRISPR系統(tǒng)還難稱完美,所以它依然在不斷升級和完善之中。僅在近期,就有多個捷報傳來:例如開發(fā)出迄今為止最小的CRISPR、圍繞CRISPR系統(tǒng)開發(fā)RNA遞送平臺等等。這些研究進(jìn)展都會使CRISPR這把基因剪刀越來越強大。

  科技日報北京9月5日電(記者張夢然)據(jù)近日發(fā)表在《分子細(xì)胞》雜志上的一項研究,一種名為CasMINI的緊湊高效的CRISPR-Cas系統(tǒng)可廣泛用于細(xì)胞工程和基因治療,因為它更容易進(jìn)入細(xì)胞。

  美國斯坦福大學(xué)生物工程助理教授齊磊表示,這是CRISPR基因組工程應(yīng)用向前邁出的關(guān)鍵一步。據(jù)我們所知,作為一種基因組編輯技術(shù),這是迄今為止最小的CRISPR。如果將Cas9視為分子剪刀,那么我們創(chuàng)造的就是一把包含多種功能的瑞士軍刀。

  CRISPR-Cas系統(tǒng)為開發(fā)各種遺傳疾病的基因療法提供了機會,但它們尺寸太大,遞送到細(xì)胞、組織或生物體中會受限制,從而阻礙臨床應(yīng)用,因此需要設(shè)計更加高效、緊湊的Cas系統(tǒng)。

  一種可能的解決方案是Cas12f。該蛋白介于400—700個氨基酸之間,大小還不到目前使用的CRISPR系統(tǒng)(如Cas9或Cas12a)的一半。近年來已經(jīng)鑒定出數(shù)千個CRISPR。齊磊解釋說,然而,超過99。9%的已發(fā)現(xiàn)CRISPR無法在人類細(xì)胞中發(fā)揮作用,這限制了它們作為基因組編輯技術(shù)的使用。

  在這項新研究中,齊磊及其團隊將RNA和蛋白工程應(yīng)用于Cas12f系統(tǒng),以生成用于哺乳動物基因組工程的高效微型Cas系統(tǒng)。Cas12f天然起源于古細(xì)菌(單細(xì)胞生物),這意味著它不太適合哺乳動物細(xì)胞,更不用說人類細(xì)胞或身體。但通過優(yōu)化單向?qū)NA設(shè)計并進(jìn)行多輪迭代蛋白工程和篩選,研究人員最終生成了一類名為CasMINI的Cas12f變體。

  工程化的Cas12f蛋白變體與工程化的單向?qū)NA相結(jié)合,表現(xiàn)出有效的基因調(diào)控和基因編輯活性。CasMINI可以驅(qū)動與Cas12a相關(guān)的高水平基因活性,并允許進(jìn)行穩(wěn)健的堿基編輯和基因編輯。此外,它具有高度特異性,不會產(chǎn)生可檢測的脫靶效應(yīng)。

  工程化CasMINI分子的大小僅為529個氨基酸。這種小尺寸使其適用于廣泛的治療。此外,CasMINImRNA可以很容易地包裝到脂質(zhì)納米顆粒或其他RNA遞送方式中,潛在地增強了其進(jìn)入細(xì)胞的能力。

  微型CasMINI的可及性實現(xiàn)了新的應(yīng)用,從體外應(yīng)用(例如設(shè)計更好的腫瘤殺傷淋巴細(xì)胞或重編程干細(xì)胞)到體內(nèi)基因療法(治療眼睛、肌肉或肝臟的遺傳疾病)。齊磊說,它將成為治療遺傳疾病、治愈癌癥和逆轉(zhuǎn)器官退化的方法。

  總編輯圈點

  與前幾代基因編輯工具,如鋅指酶相比,CRISPR系統(tǒng)已經(jīng)憑借其成本低廉、簡便易用,風(fēng)靡全球眾多生物醫(yī)學(xué)實驗室,成為該領(lǐng)域無數(shù)科研人員手中的高效工具。盡管如此,CRISPR系統(tǒng)還難稱完美,所以它依然在不斷升級和完善之中。僅在近期,就有多個捷報傳來:例如開發(fā)出迄今為止最小的CRISPR、圍繞CRISPR系統(tǒng)開發(fā)RNA遞送平臺等等。這些研究進(jìn)展都會使CRISPR這把基因剪刀越來越強大。

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